Novembre 2021#

Bonjour,

Pour commencer cet article énumérant les nouveautés qui vont arriver : New features coming in Julia 1.7.

Vous pouvez tester la première version « wasm » de Julia. Merci à Loic G. pour le lien.

Le groupe calcul organise un café virtuel qui s’intitule « Questions-Réponses : Julia pour les sciences du vivant » avec Rémi Vezy, chercheur au CIRAD, le 19 novembre 2021 à 10:00 en ligne. Vous trouverez toutes les infos en suivant le lien et inscrivez-vous nombreux.

Sur le même sujet un article a été publié sur la plateforme Arxiv : « Julia for Biologists ». Vous y trouverez un schéma avec l’ensemble des packages déjà disponibles en Julia pour les sciences du vivant.

Billets de blog#

Packages#

  • TableDistances.jl: excellent package en complément du tout aussi excellent Distances.jl. Très utile pour coder les méthodes à noyau et le clustering.

  • Working with Flux.jl models on the Hugging Face Hub: exemple fun du package de deep learning Flux.jl.

  • BranchAndBound.jl: le code date un peu mais c’est un bon exemple d’implémentation de l’algorithme par séparation et évaluation pour résoudre un problème d’optimisation.

  • ClusterAnalysis.jl: petit package qui proposent deux algorithmes de clustering. C’est propre, clair, avec un code documenté et des exemples. N’hésitez pas à regarder le code source.

  • TaskDAGAnalyzers.jl: package pour visualiser le graphe de tâches lors d’une parallèlisation.

  • Graphs.jl: c’est le nouveau package pour manipuler les graphes en Julia. Il remplace LightGraphs.jl qui est archivé désormais.

Vidéos#

Tutoriels et documentation#

Les bulletins précédents sont disponibles sur https://pnavaro.github.io/NouvellesJulia

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